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AWS云端运算加速辨识溯源13万种RNA病毒研究

防范全球传染病大爆发再添利器,Amazon Web Services(AWS)宣布近期与加拿大哥伦比亚大学云端创新中心(UBC CIC)合作,以AWS云端科技为基础建构的超级运算平台,助力国际科学团队在短短11天内搜集了近600万份公开可用的生物样本,成功辨识超过13万种新型RNA病毒,其中包括9种新型冠状病毒。若使用一台传统电脑,需要2000年才能完成。该专案实现RNA病毒研究的另一创举,透过辨识并溯源新型病毒,能够让科学家们在病毒感染人、动物、农作物和濒危物种前,提早防范对策。


图一 : AWS助力科学家助力国际科学团队在11天内搜集近600万份公开可用的生物样本,发现13万种RNA病毒,其中包括9种新型冠状病毒。
图一 : AWS助力科学家助力国际科学团队在11天内搜集近600万份公开可用的生物样本,发现13万种RNA病毒,其中包括9种新型冠状病毒。

在AWS的帮助下,UBC CIC团队和全球计算生物学家发起开放病毒专案The Open Virome,并建立开放性病毒侦测云端运算平台Serratus。目前该研究成果创建公开病毒资料库,向全球科学界分享研究成果,帮助加速对RNA病毒的研究。由RNA病毒引起的疾病包含流行性感冒、严重急性呼吸道症候群(SARS)、新冠肺炎、C型肝炎、伊波拉病毒和麻疹等。由於RNA病毒繁殖和进化速度快,在此之前,科学家们经过几十年的资料分析,只发现了1.5万种病毒。而在使用AWS的基础架构和服务後,The Open Virome专案团队在发现新病毒方面,已为科学界节省了数百万美元和长达数年的时间。


基於AWS服务所取得的研究成果,彻底改变了生物资讯学的研究方式。病毒的辨识和研究需要分析海量的基因定序数据,其中包括数十万种未知病毒的DNA和RNA。基因组学的资料量每天都以倍速增长,造成病毒定序资料库的总量庞大,依靠传统运算方式根本无法对其进行全面分析或处理。
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