在美國與大陸軍機擦撞事件之後，台灣即將面臨5月20日總統就職滿週年前夕。根據網路安全專家表示，大陸駭客可能會攻擊台灣政府單位的相關網站，同時根據電信業者表示，目前在網路上流傳的「木馬程式」有增多的趨勢。

根據新波科技表示，保守估計全世界約有2000 ~3000種的木馬後門程式，其中包括在中國大陸頗負盛名的「冰河木馬程式」，美國的「BO2000木馬程式」等等。而法國，德國，俄羅斯與荷蘭也都有十分刁鑽的「木馬程式」。可是，一般防毒軟體只能針對已知型的木馬程式進行偵測，對於「未知型的木馬」(由駭客自創的木馬)或「變種木馬」(由常見的木馬程式所改編)，常常是防毒軟體所無法掃除的。如此一來，防毒軟體的「漏網之馬」，將會在電腦主機造成更大的破壞。因此，網路安全不能完全依賴防毒軟體獨挑大樑。

再者，雖然多數的網站都已經裝置網路防火牆。不過，防火牆所建立的網路安全機制，是以「阻擋非法網路封包」為主要保護方式。基本上，防火牆一定要開啟數個對外通訊的連接埠 (Port)，駭客的攻擊封包將會穿透這些防火牆的通訊連接埠，攻擊並破壞網站的資料。更何況著名防火牆的網路安全漏洞也時有所聞。例如，在幾週前，網路駭客才發現微軟的ISA防火牆有若干漏洞，可能被駭客做為滲透攻擊的手法。

針對此次美國與大陸駭客的互相攻擊事件，網路安全業者表示：根據這段期間所統計的資料發現，目前有不少台灣網站被美國駭客誤判為大陸網站，進而攻擊該網站，可能是網站名稱有「china」或網站有漏洞所致。而遭受攻擊的台灣網站已有數十家，被入侵的學校主機可能有數百所左右，並持續增加當中。為防範5月20日總統就職週年的事件造成政府及企業的損失，新波科技將全力支援各政府單位因應即將到來的網站危機，提出安全的網路保護機制，保護各類網站的資料安全，並針對各單位使用之Sun-Solaris、Windows NT、Linux系統，提供嚴密的網路安全保護計劃，並監控系統運作和網路流量。