Red Hat最新版Fedora Core 2出现无法与Windows兼容的问题，这问题在测试时就已经存在，但自上(5)月正式发表Fedora Core 2后，有更多的用户反应，在安装好Linux更新之后，就无法启动装在同一台计算机上的Windows。

据cnet消息指出，由于Windows里的数据完全未受损害，而且手动重新设定好硬盘组态之后可以解决该问题，因此Red Hat响应认为问题并不严重，但该公司也正着手要出版修复档来解决这问题，以解决用户的烦恼。该公司工程师指出问题显然和计算机对于硬盘机实体配置（layout）的描述有关，也就是硬盘的分割表。

由于Fedora Core是玩家及开发者的免费Linux版本，该公司对于Fedora稳定上的问题直言无讳，网站上明白声明表示：「Fedora Project不在红帽的技术支持内。」因此用户只能供该公司参考，Red Hat并不需负什么责任。

Fedora Core的设计是为了要满足一些人对最新软件的胃口，同时Red Hat也可藉此改进并加速这款操作系统在商用计算机上的采用。在Red Hat采取收费策略后，该公司软件只剩Fedora Core 2可免费取得，而Enterprise Linux每年的技术支持费用受费在349至18000美元之间。