台南科学园区厂商开发再添变数，解决水电问题之后，再爆发文化遗址问题。正在赶工开发的奇美LCM组装厂，及联电南科基地都发现文化遗址，而且在保护文化资源原则下，必须先抢救遗址才能继续开发，厂商的开发时程势必受影响。

南科开发筹备处主任戴谦表示，由于南科区内目前已无闲置土地，即使开工之后才发现工地内存有文化遗址，也没有土地可供更换，筹备处倾向文化遗址抢救或保留的方式，处理完成之后，再继续兴建厂房。台南科学园区开发以来，虽然陆续发现三处文化遗址，分别为道爷、北三舍、五间厝、三抱竹遗址，并由中研院人员进行抢救，但由于这些遗址所在位址多半是公共工程所在，并未影响到南科厂商的开发时程。