華邦電子於南科興建12吋晶圓廠一案，因為高鐵經過產生地面振動之影響，恐將劃下休止符。據華邦電子董事長焦佑鈞20日透露，華邦已確定把原計劃在南科興建的12吋晶圓廠，另覓妥適的地點。焦佑鈞表示，華邦電子12吋晶圓廠投資金額金額高達1000億元，不可輕易冒險設廠，目前正在評估遷至路竹園區或其他地區的可行性。

而為了解決高鐵振動問題，國科會副主委薛香川也將於最近向行政院提出建議方案，建議案擬把高鐵鐵道經過南科園區部份的橋墩間距，由原本的30公尺縮短至6公尺。另外，為了避免造成半導體廠過度集中，薛香川也建議疏導部份廠商至路竹園區設廠。