据大陆媒体报导指出，Windows Server 2003作业系统备份的文件，在旧有版本的Windows中无法读取。微软上个月于总部发布Windows Server 2003时，即强调其在跨平台操作的优越性，如今在自身平台上出现不相容的问题，业界认为将使微软“蒙羞”。

据报导，不相容问题是应用方案提供商Terabyte电脑公司于4月下旬最早发现的，随后​​多家国外媒体报导了这项消息。日前微软总部承认了这个问题的严重性，并调查出问题原因，指出Windows Server 2003的备份程式使用的是64KB，而以前版本的作业系统Windows XP Pro和Window 2000，以及Windows NT4中的备份程式使用的是32KB。

业界人士指出，微软在跨平台开发工具方面一直受制于人，很多专业人士使用大型系统时，为顾及系统安全性而选择了UNIX或Linux系统。而Windows Server 2003最大的突破是支援了XML，在Windows Server 2003推出前后，微软特别强调了此产品在跨平台操作的优越性。如今发生产品不相容问题，可能会让使用者对Windows Server 2003产生疑虑。

中国微软表示，在5月22日正式发布Windows Server 2003简体中文版之前​​，微软已经在中国展开大规模的教育与培训工作，目前有超过三千个合作厂商人员接受新作业系统的培训，并邀请了许多国内外知名软硬体厂商参与相关的相容测试计划。目前大陆所有用户和合作伙伴并没有发现此问题，推断只有在使用某项特殊功能时才可能发生，因此并非系统出现问题，一切都要等微软进一步的测试工作完成后才能有定论。