两岸因为政策、经济等的不同，因此，在网络通讯的交流上也存在着许多问题，早已不足为奇。宏碁软件事业群总经理杜紫宸在「两岸产业科技合作发展研讨会」第二天的分组讨论上就表示，两岸的信息与网络产业，除了风险投资、企业孵化机制外，还包括合作制定中文应用技术标准、共同开发具庞大潜力的网络应用服务市场。另外，除了开发大陆市场，更应结合双方技术及非技术优势，共同开发亚洲市场。

杜紫宸以「新经济时代两岸网络电子商务的合作模式」为主题发表看法，他认为，两岸必须在如cnXML、3G等中文应用技术标准创造一些基础，过去五六年当中两岸在中文字码的成功合作是好的开始。而除了硬件的基础建设外，他表示还有网络上能开发的应用需求，不论是服务业的三级产业、制造业的二级产业，都有相当的发挥空间。此外，他在会中也指出，两岸应共同开发出以企业竞争力为核心概念的整体电子商务解决方案，因为当前两岸的电子商务后台支持相当不健全。